Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB3Q05901 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms