Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms