Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms