Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XPCQ01831 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XPCQ01831 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XPCQ01831 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XPCQ01831 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms