Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN7AQ01118 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCN7AQ01118 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms