Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2C1P98194 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms