Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPAP53621 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPAP53621 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPAP53621 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms