Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOSBP53539 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOSBP53539 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOSBP53539 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms