Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRCA2P51587 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms