Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB28P51157 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms