Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIP4K2AP48426 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms