Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms