Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms