Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms