Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBP1P32455 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms