Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5DP30049 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms