Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms