Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms