Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHGAP10645 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms