Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TMEM225BP0DP42 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TMEM225BP0DP42 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TMEM225BP0DP42 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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