Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms