Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRPRAP08240 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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