Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJB1P08034 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJB1P08034 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms