Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms