Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL18O94889 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL18O94889 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL18O94889 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms