Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN3O75935 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms