Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF3BO15066 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF3BO15066 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms