Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC4-APOC2K7ER74 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms