Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms