Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms