Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms