Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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