Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms