Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms