Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms