Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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