Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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