Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms