Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSD3Q9NYI0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms