Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD8Q9NX08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD8Q9NX08 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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