Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms