Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6BQ9NRW1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms