Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HMG20AQ9NP66 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HMG20AQ9NP66 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HMG20AQ9NP66 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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