Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms