Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms