Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms