Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms