Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms