Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIRIP3Q9BW71 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms