Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms